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组织经固定后会有大量水分，组织脱水是用某些溶剂逐渐将组织内的水分置换出来，以利于透明剂和石蜡的渗入，从而保证组织硬度，避免切片时产生组织变形。
流程
组织脱水主要包含脱水、透明、浸蜡等环节。
脱水
脱水的目的是将组织内的水分用某些化学试剂置换出来，使组织内外的脱水剂浓度达到平衡状态。
脱水剂的特点是能够同时以任何比例与水和透明剂混合。根据其效果和性质可分为单纯脱水剂（如乙醇、丙酮等）和脱水兼透明剂（如正丁醇、异丁醇等），其中乙醇最为常用。
透明
透明的目的是用某些化学试剂将组织中的脱水剂置换出来，以利于浸蜡和包埋，组织块浸入这些试剂后呈半透明状。
透明剂的特点是既可与脱水剂相溶又能和包埋剂相溶。常见的透明剂有二甲苯、苯、氯仿、正丁醇等。其中最常用的是二甲苯，其特点是无色、透明、有毒、易挥发，透明作用极强。
浸蜡
浸蜡的目的是用石蜡等支持物去置换、替代组织中的透明剂，使组织具有一定的硬度，有利于切片
最常使用的浸透剂是石蜡（既是浸透剂又是包埋剂）
注意事项
技术人员必须经过培训、考核合格后方能上岗进行各项操作
组织固定必须充分，不充分时，脱水剂乙醇会凝固蛋白质，引起组织收缩和硬化
组织处理所使用的试剂体积至少时组织体积的5倍
乙醇在脱水时应从低浓度向高浓度逐级进行脱水
脱水处理过程应缓慢进行，脱水不足会使透明剂渗透到组织内部困难，同时组织水分过多标本发软，或无法透明
脱水试剂应根据处理的组织块数，使用时间及频次进行更换
更换试剂时，要注意换液方式及液体的浓度，如果位置调换错误或浓度有误，会使组织表面硬化，导致组织内部的水分无法被置换出来
根据组织固定程度和组织块大小设定时间，手术标本的处理时间一般大于活检标本处理时间，最好能分开处理
如果使用加温方式进行脱水，要缩短处理时间，一般温度不宜超过45℃，试剂更换间隔也应缩短
减少组织处理过程中二甲苯带进入石蜡中的量，如果脱水不彻底或脱水机浓度降低，组织内含有少量水份，会阻碍石蜡的渗透，导致组织变干、变脆、变硬
石蜡熔化应在温箱或熔蜡箱内进行，熔解后使用上清石蜡，不能使用明火加热
浸蜡时间应根据组织种类、大小确定。时间过长，易造成组织变硬、变脆，切片易碎；时间不足，会导致组织较软，难以切成完好切片
更换试剂时，所有试剂应按医疗废液处理，石蜡按谷提医疗废物处理，不能随意倾倒
应建立一系列易燃化学物品的使用管理制度，并定期培训及演练，以确保安全使用。
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