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在日常操作过程中，安全柜内部应分为3个区，依次为洁净区、工作区、污染区。洁净区用于摆放吸头盒、培养基等必要物品；工作区用于无菌操作；废弃吸头等弃于位于污染区的垃圾盒内。
2、注意进气格栅
安全柜的进气格栅通常位于操作台前方，在操作时应尽量避免衣袖遮挡进气格栅干扰安全柜的安全气流，从而带来安全隐患。如图2所示：左边是非正确操作-----操作人员手臂和实验物品挡住了格栅；右边为正确操作-----安全柜搁手架高于操作台面，操作人员手臂避免了遮挡进气格栅。
3、勿放置过多物品
安全柜的操作台除了前面有进气格栅，后面也有格栅。如果在操作过程中放置的物品遮挡住后格栅，也会影响安全气流，给操作带来安全隐患。
4、保持操作台面下方清洁
建议定期将安全柜操作台面提起，清理台面下方区域，保持该区域清洁。如图4 所示为非正确操作-----台面下方的污物易造成样品污染。
5、正确使用紫外灯
紫外灯杀菌的特点是快速、方便、易遮挡。因此，在使用紫外灯照射工作台时应保证内部干净无遮挡物品。
6、安全柜内勿使用酒精灯
正规合格的安全柜无需酒精灯即可进行无菌操作。点燃酒精灯还有可能干扰安全柜内的安全气流，使用不当还可能造成核心部件如超高效过滤器损坏，因此不建议在安全柜内使用酒精灯。
7、超净工作台≠生物安全柜
超净工作台不等同于生物安全柜，超净工作台只保护工作区的样品免受外来污染，适用于需要局部洁净无菌工作环境的试验操作。生物安全柜可以为人员，样品提供双重保护，是一种能防止实验操作处理过程中含有危险性或未知性生物微粒发生气溶胶散逸的安全防护设备。
8、进行特殊材料操作的注意事项
在处理特殊材料操作，例如，有毒，易燃，易爆等材料之前，应当由专业的生物安全专员或工程师来确定生物安全柜是否适用于您的应用需求。
9、正确选择生物安全柜的放置地点
安全柜应当尽量远离外部气流干扰因素，例如门窗、空调通风口、人员过道以及其他实验室气流干扰设备（如同房间的其他生物安全柜、通风橱或者超净工作台等）。
10、安全柜警报响起时请勿继续操作
当安全柜的警报系统触发时，请立即停止手上的工作，并联系专业的工程师。
11、 请勿在生物安全柜内摆放过多物品
安全柜的工作区域内严禁堆积过多的物品，以免影响安全柜本身的气流和安全性能。
12、避免对气流屏障的干扰
请遵循缓慢移动原则，操作时手臂应尽量水平缓慢移动，以避免影响正常的气流状态。避免垂直和过快移动造成污染物外泄。
13、安全柜自净周期
开启安全柜时，让安全柜先自主运行3-15分钟，来达到气流的稳定和净化操作区的空气以达到相应的洁净度级别。然后操作者再进行相关的实验操作即可。
14、正确的生物安全柜工作高度
请确保安全柜在工作时前窗处于规定的安全高度。
15、在安全区域内进行操作
切勿阻塞安全柜前窗处的进气格栅和工作腔内的空气回流孔。尽量在工作区的中心部位进行操作。
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